Protein–RNA interactions for Protein: P63239

Pcsk1, Neuroendocrine convertase 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1P63239 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcsk1P63239 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcsk1P63239 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcsk1P63239 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcsk1P63239 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcsk1P63239 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcsk1P63239 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcsk1P63239 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcsk1P63239 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcsk1P63239 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcsk1P63239 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcsk1P63239 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcsk1P63239 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcsk1P63239 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcsk1P63239 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcsk1P63239 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcsk1P63239 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcsk1P63239 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms