Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnrpnP63163 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnrpnP63163 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnrpnP63163 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnrpnP63163 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnrpnP63163 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnrpnP63163 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnrpnP63163 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SnrpnP63163 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SnrpnP63163 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SnrpnP63163 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SnrpnP63163 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnrpnP63163 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnrpnP63163 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnrpnP63163 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnrpnP63163 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SnrpnP63163 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SnrpnP63163 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SnrpnP63163 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SnrpnP63163 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SnrpnP63163 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnrpnP63163 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnrpnP63163 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnrpnP63163 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnrpnP63163 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnrpnP63163 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnrpnP63163 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnrpnP63163 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnrpnP63163 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SnrpnP63163 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms