Protein–RNA interactions for Protein: P61967

Ap1s1, AP-1 complex subunit sigma-1A, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s1P61967 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ap1s1P61967 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ap1s1P61967 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ap1s1P61967 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ap1s1P61967 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms