Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abce1P61222 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Abce1P61222 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abce1P61222 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abce1P61222 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abce1P61222 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abce1P61222 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abce1P61222 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abce1P61222 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms