Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arf3P61205 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arf3P61205 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arf3P61205 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arf3P61205 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arf3P61205 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arf3P61205 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arf3P61205 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arf3P61205 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arf3P61205 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Arf3P61205 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms