Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2d1P61080 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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