Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CirbpP60824 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CirbpP60824 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CirbpP60824 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CirbpP60824 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CirbpP60824 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CirbpP60824 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CirbpP60824 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CirbpP60824 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CirbpP60824 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CirbpP60824 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms