Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b6P59708 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b6P59708 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3b6P59708 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3b6P59708 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms