Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hps5P59438 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hps5P59438 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hps5P59438 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hps5P59438 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hps5P59438 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hps5P59438 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hps5P59438 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hps5P59438 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hps5P59438 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hps5P59438 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hps5P59438 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms