Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Setd4P58467 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Setd4P58467 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Setd4P58467 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Setd4P58467 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Setd4P58467 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Setd4P58467 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Setd4P58467 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Setd4P58467 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Setd4P58467 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Setd4P58467 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Setd4P58467 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Setd4P58467 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Setd4P58467 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Setd4P58467 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Setd4P58467 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Setd4P58467 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Setd4P58467 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Setd4P58467 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Setd4P58467 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Setd4P58467 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Setd4P58467 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Setd4P58467 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Setd4P58467 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Setd4P58467 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Setd4P58467 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Setd4P58467 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Setd4P58467 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Setd4P58467 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Setd4P58467 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Setd4P58467 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Setd4P58467 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Setd4P58467 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Setd4P58467 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Setd4P58467 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms