Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Strn4P58404 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Strn4P58404 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Strn4P58404 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Strn4P58404 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Strn4P58404 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Strn4P58404 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Strn4P58404 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Strn4P58404 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Strn4P58404 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Strn4P58404 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Strn4P58404 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Strn4P58404 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Strn4P58404 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Strn4P58404 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Strn4P58404 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Strn4P58404 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Strn4P58404 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Strn4P58404 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Strn4P58404 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Strn4P58404 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Strn4P58404 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Strn4P58404 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Strn4P58404 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Strn4P58404 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Strn4P58404 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Strn4P58404 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Strn4P58404 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Strn4P58404 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Strn4P58404 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Strn4P58404 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Strn4P58404 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Strn4P58404 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Strn4P58404 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Strn4P58404 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Strn4P58404 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Strn4P58404 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Strn4P58404 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Strn4P58404 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Strn4P58404 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Strn4P58404 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Strn4P58404 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Strn4P58404 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Strn4P58404 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Strn4P58404 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Strn4P58404 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Strn4P58404 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Strn4P58404 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Strn4P58404 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Strn4P58404 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Strn4P58404 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Strn4P58404 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Strn4P58404 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Strn4P58404 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Strn4P58404 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Strn4P58404 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Strn4P58404 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Strn4P58404 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Strn4P58404 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Strn4P58404 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Strn4P58404 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Strn4P58404 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Strn4P58404 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Strn4P58404 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Strn4P58404 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Strn4P58404 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Strn4P58404 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Strn4P58404 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Strn4P58404 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Strn4P58404 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Strn4P58404 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Strn4P58404 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Strn4P58404 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Strn4P58404 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Strn4P58404 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Strn4P58404 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Strn4P58404 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Strn4P58404 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Strn4P58404 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Strn4P58404 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Strn4P58404 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Strn4P58404 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Strn4P58404 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Strn4P58404 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Strn4P58404 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Strn4P58404 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Strn4P58404 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Strn4P58404 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Strn4P58404 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Strn4P58404 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Strn4P58404 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Strn4P58404 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Strn4P58404 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Strn4P58404 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Strn4P58404 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Strn4P58404 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Strn4P58404 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Strn4P58404 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Strn4P58404 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Strn4P58404 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms