Protein–RNA interactions for Protein: P57780

Actn4, Alpha-actinin-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn4P57780 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Actn4P57780 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actn4P57780 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Actn4P57780 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn4P57780 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn4P57780 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Actn4P57780 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Actn4P57780 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Actn4P57780 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms