Protein–RNA interactions for Protein: P56657

Cyp2c40, Cytochrome P450 2C40, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c40P56657 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cyp2c40P56657 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cyp2c40P56657 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cyp2c40P56657 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cyp2c40P56657 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cyp2c40P56657 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cyp2c40P56657 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cyp2c40P56657 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cyp2c40P56657 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cyp2c40P56657 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cyp2c40P56657 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Cyp2c40P56657 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cyp2c40P56657 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cyp2c40P56657 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cyp2c40P56657 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cyp2c40P56657 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cyp2c40P56657 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cyp2c40P56657 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Cyp2c40P56657 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cyp2c40P56657 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cyp2c40P56657 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cyp2c40P56657 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cyp2c40P56657 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cyp2c40P56657 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cyp2c40P56657 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cyp2c40P56657 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cyp2c40P56657 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cyp2c40P56657 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cyp2c40P56657 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cyp2c40P56657 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cyp2c40P56657 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cyp2c40P56657 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Cyp2c40P56657 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cyp2c40P56657 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cyp2c40P56657 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cyp2c40P56657 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cyp2c40P56657 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cyp2c40P56657 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cyp2c40P56657 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cyp2c40P56657 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cyp2c40P56657 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cyp2c40P56657 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cyp2c40P56657 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cyp2c40P56657 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cyp2c40P56657 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cyp2c40P56657 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cyp2c40P56657 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cyp2c40P56657 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Cyp2c40P56657 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cyp2c40P56657 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cyp2c40P56657 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cyp2c40P56657 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cyp2c40P56657 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Cyp2c40P56657 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cyp2c40P56657 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Cyp2c40P56657 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cyp2c40P56657 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cyp2c40P56657 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cyp2c40P56657 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cyp2c40P56657 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cyp2c40P56657 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cyp2c40P56657 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cyp2c40P56657 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cyp2c40P56657 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cyp2c40P56657 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Cyp2c40P56657 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cyp2c40P56657 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cyp2c40P56657 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cyp2c40P56657 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cyp2c40P56657 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cyp2c40P56657 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cyp2c40P56657 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cyp2c40P56657 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cyp2c40P56657 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms