Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp1P55194 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp1P55194 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms