Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pex2P55098 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pex2P55098 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pex2P55098 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pex2P55098 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pex2P55098 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Pex2P55098 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pex2P55098 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pex2P55098 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pex2P55098 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pex2P55098 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms