Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Faf1P54731 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Faf1P54731 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Faf1P54731 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Faf1P54731 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Faf1P54731 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Faf1P54731 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Faf1P54731 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Faf1P54731 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Faf1P54731 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Faf1P54731 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Faf1P54731 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Faf1P54731 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Faf1P54731 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Faf1P54731 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Faf1P54731 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Faf1P54731 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Faf1P54731 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Faf1P54731 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Faf1P54731 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Faf1P54731 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Faf1P54731 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Faf1P54731 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Faf1P54731 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Faf1P54731 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Faf1P54731 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Faf1P54731 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Faf1P54731 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Faf1P54731 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Faf1P54731 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Faf1P54731 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Faf1P54731 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Faf1P54731 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Faf1P54731 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Faf1P54731 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Faf1P54731 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms