Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cacnb3P54285 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cacnb3P54285 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cacnb3P54285 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cacnb3P54285 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cacnb3P54285 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cacnb3P54285 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cacnb3P54285 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacnb3P54285 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacnb3P54285 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacnb3P54285 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacnb3P54285 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacnb3P54285 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacnb3P54285 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacnb3P54285 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacnb3P54285 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacnb3P54285 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacnb3P54285 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacnb3P54285 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacnb3P54285 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacnb3P54285 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacnb3P54285 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacnb3P54285 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacnb3P54285 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacnb3P54285 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacnb3P54285 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacnb3P54285 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cacnb3P54285 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms