Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efnb1P52795 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efnb1P52795 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 284.8 ms