Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SqleP52019 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SqleP52019 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SqleP52019 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SqleP52019 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SqleP52019 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SqleP52019 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SqleP52019 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SqleP52019 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SqleP52019 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SqleP52019 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SqleP52019 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SqleP52019 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SqleP52019 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SqleP52019 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SqleP52019 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SqleP52019 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SqleP52019 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SqleP52019 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SqleP52019 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SqleP52019 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SqleP52019 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SqleP52019 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SqleP52019 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SqleP52019 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SqleP52019 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SqleP52019 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SqleP52019 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SqleP52019 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SqleP52019 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SqleP52019 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SqleP52019 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SqleP52019 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SqleP52019 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SqleP52019 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SqleP52019 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SqleP52019 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SqleP52019 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SqleP52019 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SqleP52019 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SqleP52019 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SqleP52019 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SqleP52019 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SqleP52019 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SqleP52019 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SqleP52019 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SqleP52019 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SqleP52019 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SqleP52019 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SqleP52019 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SqleP52019 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SqleP52019 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SqleP52019 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SqleP52019 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SqleP52019 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SqleP52019 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SqleP52019 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SqleP52019 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SqleP52019 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SqleP52019 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SqleP52019 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SqleP52019 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SqleP52019 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SqleP52019 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SqleP52019 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SqleP52019 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SqleP52019 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SqleP52019 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SqleP52019 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SqleP52019 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SqleP52019 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SqleP52019 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SqleP52019 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SqleP52019 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SqleP52019 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SqleP52019 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SqleP52019 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SqleP52019 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SqleP52019 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SqleP52019 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SqleP52019 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SqleP52019 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SqleP52019 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SqleP52019 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SqleP52019 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SqleP52019 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SqleP52019 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SqleP52019 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SqleP52019 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SqleP52019 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SqleP52019 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SqleP52019 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SqleP52019 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SqleP52019 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SqleP52019 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SqleP52019 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SqleP52019 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SqleP52019 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SqleP52019 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SqleP52019 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 194.6 ms