Protein–RNA interactions for Protein: P51827

Aff3, AF4/FMR2 family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff3P51827 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aff3P51827 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aff3P51827 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aff3P51827 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aff3P51827 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aff3P51827 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aff3P51827 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aff3P51827 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aff3P51827 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Aff3P51827 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aff3P51827 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Aff3P51827 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aff3P51827 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aff3P51827 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aff3P51827 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aff3P51827 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aff3P51827 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aff3P51827 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aff3P51827 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aff3P51827 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aff3P51827 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aff3P51827 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Aff3P51827 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aff3P51827 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aff3P51827 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aff3P51827 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aff3P51827 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aff3P51827 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aff3P51827 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aff3P51827 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aff3P51827 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aff3P51827 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aff3P51827 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aff3P51827 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aff3P51827 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aff3P51827 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aff3P51827 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aff3P51827 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Aff3P51827 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aff3P51827 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Aff3P51827 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aff3P51827 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Aff3P51827 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aff3P51827 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aff3P51827 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aff3P51827 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aff3P51827 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aff3P51827 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aff3P51827 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Aff3P51827 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aff3P51827 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aff3P51827 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aff3P51827 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aff3P51827 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aff3P51827 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aff3P51827 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aff3P51827 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aff3P51827 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aff3P51827 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms