Protein–RNA interactions for Protein: P51675

Ccr1, C-C chemokine receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr1P51675 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccr1P51675 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccr1P51675 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms