Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FmodP50608 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FmodP50608 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FmodP50608 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FmodP50608 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FmodP50608 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FmodP50608 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FmodP50608 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FmodP50608 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FmodP50608 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FmodP50608 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FmodP50608 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FmodP50608 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FmodP50608 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FmodP50608 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FmodP50608 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FmodP50608 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FmodP50608 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FmodP50608 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FmodP50608 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FmodP50608 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FmodP50608 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FmodP50608 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FmodP50608 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FmodP50608 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FmodP50608 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FmodP50608 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FmodP50608 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FmodP50608 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FmodP50608 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FmodP50608 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FmodP50608 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FmodP50608 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FmodP50608 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FmodP50608 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FmodP50608 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FmodP50608 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FmodP50608 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FmodP50608 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FmodP50608 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FmodP50608 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FmodP50608 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FmodP50608 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FmodP50608 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FmodP50608 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FmodP50608 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FmodP50608 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FmodP50608 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FmodP50608 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FmodP50608 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FmodP50608 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FmodP50608 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FmodP50608 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FmodP50608 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FmodP50608 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FmodP50608 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FmodP50608 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FmodP50608 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FmodP50608 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FmodP50608 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FmodP50608 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FmodP50608 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FmodP50608 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FmodP50608 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FmodP50608 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FmodP50608 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FmodP50608 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FmodP50608 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FmodP50608 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FmodP50608 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FmodP50608 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FmodP50608 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FmodP50608 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FmodP50608 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FmodP50608 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FmodP50608 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FmodP50608 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FmodP50608 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FmodP50608 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FmodP50608 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FmodP50608 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FmodP50608 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FmodP50608 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FmodP50608 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FmodP50608 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FmodP50608 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FmodP50608 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FmodP50608 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FmodP50608 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FmodP50608 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FmodP50608 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FmodP50608 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FmodP50608 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FmodP50608 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FmodP50608 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FmodP50608 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FmodP50608 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FmodP50608 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FmodP50608 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FmodP50608 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms