Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdkn1cP49919 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cdkn1cP49919 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms