Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VegfbP49766 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VegfbP49766 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VegfbP49766 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VegfbP49766 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VegfbP49766 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VegfbP49766 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VegfbP49766 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VegfbP49766 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VegfbP49766 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VegfbP49766 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VegfbP49766 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VegfbP49766 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VegfbP49766 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VegfbP49766 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VegfbP49766 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VegfbP49766 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VegfbP49766 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VegfbP49766 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VegfbP49766 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VegfbP49766 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VegfbP49766 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VegfbP49766 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VegfbP49766 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VegfbP49766 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VegfbP49766 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VegfbP49766 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VegfbP49766 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VegfbP49766 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VegfbP49766 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VegfbP49766 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VegfbP49766 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VegfbP49766 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VegfbP49766 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VegfbP49766 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VegfbP49766 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VegfbP49766 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VegfbP49766 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VegfbP49766 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VegfbP49766 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VegfbP49766 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VegfbP49766 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VegfbP49766 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VegfbP49766 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VegfbP49766 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VegfbP49766 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms