Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SrprbP47758 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SrprbP47758 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SrprbP47758 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SrprbP47758 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SrprbP47758 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SrprbP47758 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
SrprbP47758 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SrprbP47758 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SrprbP47758 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms