Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms