Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gdf5P43027 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gdf5P43027 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gdf5P43027 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gdf5P43027 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms