Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf9P41274 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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