Protein–RNA interactions for Protein: P41158

Elk4, ETS domain-containing protein Elk-4, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk4P41158 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Elk4P41158 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Elk4P41158 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Elk4P41158 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Elk4P41158 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Elk4P41158 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Elk4P41158 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Elk4P41158 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elk4P41158 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elk4P41158 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elk4P41158 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Elk4P41158 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Elk4P41158 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Elk4P41158 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Elk4P41158 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Elk4P41158 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Elk4P41158 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Elk4P41158 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Elk4P41158 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Elk4P41158 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Elk4P41158 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Elk4P41158 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Elk4P41158 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Elk4P41158 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Elk4P41158 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Elk4P41158 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Elk4P41158 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Elk4P41158 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Elk4P41158 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Elk4P41158 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Elk4P41158 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Elk4P41158 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms