Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VhlP40338 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VhlP40338 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VhlP40338 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VhlP40338 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VhlP40338 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VhlP40338 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VhlP40338 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VhlP40338 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VhlP40338 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VhlP40338 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VhlP40338 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VhlP40338 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VhlP40338 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VhlP40338 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VhlP40338 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VhlP40338 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VhlP40338 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VhlP40338 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VhlP40338 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VhlP40338 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VhlP40338 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VhlP40338 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VhlP40338 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VhlP40338 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VhlP40338 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VhlP40338 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VhlP40338 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VhlP40338 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VhlP40338 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VhlP40338 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VhlP40338 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VhlP40338 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VhlP40338 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VhlP40338 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VhlP40338 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VhlP40338 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VhlP40338 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VhlP40338 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VhlP40338 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VhlP40338 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VhlP40338 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VhlP40338 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VhlP40338 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VhlP40338 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VhlP40338 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VhlP40338 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VhlP40338 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VhlP40338 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VhlP40338 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VhlP40338 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VhlP40338 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VhlP40338 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VhlP40338 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VhlP40338 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VhlP40338 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VhlP40338 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VhlP40338 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VhlP40338 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VhlP40338 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VhlP40338 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VhlP40338 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VhlP40338 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VhlP40338 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VhlP40338 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VhlP40338 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VhlP40338 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VhlP40338 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VhlP40338 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VhlP40338 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VhlP40338 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VhlP40338 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VhlP40338 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VhlP40338 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VhlP40338 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VhlP40338 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VhlP40338 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VhlP40338 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VhlP40338 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VhlP40338 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VhlP40338 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VhlP40338 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VhlP40338 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VhlP40338 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VhlP40338 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VhlP40338 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VhlP40338 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VhlP40338 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VhlP40338 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VhlP40338 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VhlP40338 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VhlP40338 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VhlP40338 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VhlP40338 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VhlP40338 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VhlP40338 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VhlP40338 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VhlP40338 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VhlP40338 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VhlP40338 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms