Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Chd1P40201 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Chd1P40201 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Chd1P40201 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Chd1P40201 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Chd1P40201 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Chd1P40201 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Chd1P40201 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Chd1P40201 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Chd1P40201 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Chd1P40201 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Chd1P40201 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Chd1P40201 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Chd1P40201 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Chd1P40201 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Chd1P40201 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Chd1P40201 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Chd1P40201 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Chd1P40201 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Chd1P40201 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Chd1P40201 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Chd1P40201 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Chd1P40201 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Chd1P40201 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Chd1P40201 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Chd1P40201 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Chd1P40201 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Chd1P40201 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Chd1P40201 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Chd1P40201 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Chd1P40201 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Chd1P40201 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Chd1P40201 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Chd1P40201 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Chd1P40201 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Chd1P40201 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Chd1P40201 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Chd1P40201 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Chd1P40201 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Chd1P40201 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Chd1P40201 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Chd1P40201 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Chd1P40201 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Chd1P40201 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Chd1P40201 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Chd1P40201 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Chd1P40201 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Chd1P40201 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Chd1P40201 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Chd1P40201 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Chd1P40201 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Chd1P40201 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Chd1P40201 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Chd1P40201 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Chd1P40201 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Chd1P40201 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Chd1P40201 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Chd1P40201 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Chd1P40201 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Chd1P40201 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Chd1P40201 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Chd1P40201 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Chd1P40201 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
Chd1P40201 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Chd1P40201 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Chd1P40201 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Chd1P40201 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Chd1P40201 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Chd1P40201 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Chd1P40201 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Chd1P40201 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC33.76■■■■□ 3
Chd1P40201 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Chd1P40201 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Chd1P40201 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Chd1P40201 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Chd1P40201 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Chd1P40201 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Chd1P40201 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Chd1P40201 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Chd1P40201 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Chd1P40201 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Chd1P40201 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Chd1P40201 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Chd1P40201 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Chd1P40201 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Chd1P40201 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Chd1P40201 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Chd1P40201 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Chd1P40201 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Chd1P40201 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Chd1P40201 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Chd1P40201 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Chd1P40201 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Chd1P40201 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Chd1P40201 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Chd1P40201 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Chd1P40201 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Chd1P40201 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Chd1P40201 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Chd1P40201 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms