Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf1P39428 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf1P39428 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf1P39428 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf1P39428 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Traf1P39428 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Traf1P39428 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Traf1P39428 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Traf1P39428 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms