Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Col18a1P39061 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Col18a1P39061 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Col18a1P39061 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Col18a1P39061 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Col18a1P39061 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Col18a1P39061 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Col18a1P39061 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Col18a1P39061 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Col18a1P39061 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Col18a1P39061 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Col18a1P39061 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Col18a1P39061 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Col18a1P39061 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Col18a1P39061 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Col18a1P39061 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Col18a1P39061 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Col18a1P39061 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Col18a1P39061 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Col18a1P39061 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Col18a1P39061 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Col18a1P39061 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Col18a1P39061 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Col18a1P39061 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Col18a1P39061 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Col18a1P39061 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Col18a1P39061 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Col18a1P39061 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Col18a1P39061 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Col18a1P39061 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Col18a1P39061 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Col18a1P39061 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Col18a1P39061 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Col18a1P39061 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Col18a1P39061 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Col18a1P39061 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Col18a1P39061 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Col18a1P39061 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Col18a1P39061 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Col18a1P39061 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Col18a1P39061 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Col18a1P39061 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Col18a1P39061 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Col18a1P39061 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Col18a1P39061 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Col18a1P39061 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Col18a1P39061 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Col18a1P39061 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Col18a1P39061 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Col18a1P39061 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Col18a1P39061 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Col18a1P39061 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Col18a1P39061 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Col18a1P39061 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Col18a1P39061 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Col18a1P39061 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Col18a1P39061 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Col18a1P39061 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Col18a1P39061 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col18a1P39061 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col18a1P39061 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col18a1P39061 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col18a1P39061 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col18a1P39061 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col18a1P39061 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col18a1P39061 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Col18a1P39061 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Col18a1P39061 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Col18a1P39061 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Col18a1P39061 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms