Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TtlP38585 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TtlP38585 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TtlP38585 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TtlP38585 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TtlP38585 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TtlP38585 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TtlP38585 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TtlP38585 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TtlP38585 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TtlP38585 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TtlP38585 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TtlP38585 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TtlP38585 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TtlP38585 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TtlP38585 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TtlP38585 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TtlP38585 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TtlP38585 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TtlP38585 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TtlP38585 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TtlP38585 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TtlP38585 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TtlP38585 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TtlP38585 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TtlP38585 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TtlP38585 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TtlP38585 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TtlP38585 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TtlP38585 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TtlP38585 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TtlP38585 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TtlP38585 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TtlP38585 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TtlP38585 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TtlP38585 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TtlP38585 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TtlP38585 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TtlP38585 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TtlP38585 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TtlP38585 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TtlP38585 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TtlP38585 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TtlP38585 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TtlP38585 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TtlP38585 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TtlP38585 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TtlP38585 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TtlP38585 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TtlP38585 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TtlP38585 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TtlP38585 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TtlP38585 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TtlP38585 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TtlP38585 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TtlP38585 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
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TtlP38585 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TtlP38585 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TtlP38585 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TtlP38585 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TtlP38585 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TtlP38585 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TtlP38585 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TtlP38585 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TtlP38585 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TtlP38585 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TtlP38585 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TtlP38585 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TtlP38585 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TtlP38585 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TtlP38585 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TtlP38585 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TtlP38585 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TtlP38585 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TtlP38585 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TtlP38585 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TtlP38585 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TtlP38585 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TtlP38585 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TtlP38585 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TtlP38585 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TtlP38585 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TtlP38585 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TtlP38585 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TtlP38585 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TtlP38585 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TtlP38585 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TtlP38585 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TtlP38585 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TtlP38585 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TtlP38585 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TtlP38585 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TtlP38585 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TtlP38585 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TtlP38585 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TtlP38585 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TtlP38585 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TtlP38585 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TtlP38585 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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