Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pabpc1P29341 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pabpc1P29341 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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