Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ggta1P23336 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ggta1P23336 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms