Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja1P23242 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gja1P23242 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja1P23242 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja1P23242 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja1P23242 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja1P23242 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gja1P23242 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gja1P23242 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gja1P23242 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja1P23242 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja1P23242 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja1P23242 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja1P23242 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja1P23242 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja1P23242 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja1P23242 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja1P23242 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja1P23242 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja1P23242 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja1P23242 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja1P23242 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja1P23242 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja1P23242 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja1P23242 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja1P23242 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja1P23242 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja1P23242 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja1P23242 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja1P23242 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja1P23242 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja1P23242 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gja1P23242 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja1P23242 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja1P23242 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja1P23242 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja1P23242 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja1P23242 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja1P23242 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja1P23242 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja1P23242 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja1P23242 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja1P23242 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja1P23242 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja1P23242 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja1P23242 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms