Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myo5bP21271 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Myo5bP21271 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Myo5bP21271 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Myo5bP21271 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Myo5bP21271 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Myo5bP21271 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Myo5bP21271 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Myo5bP21271 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Myo5bP21271 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Myo5bP21271 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Myo5bP21271 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Myo5bP21271 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Myo5bP21271 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Myo5bP21271 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Myo5bP21271 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Myo5bP21271 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Myo5bP21271 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Myo5bP21271 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Myo5bP21271 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Myo5bP21271 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Myo5bP21271 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Myo5bP21271 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Myo5bP21271 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Myo5bP21271 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Myo5bP21271 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Myo5bP21271 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Myo5bP21271 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Myo5bP21271 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Myo5bP21271 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Myo5bP21271 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Myo5bP21271 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Myo5bP21271 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Myo5bP21271 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Myo5bP21271 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Myo5bP21271 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Myo5bP21271 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Myo5bP21271 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Myo5bP21271 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Myo5bP21271 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Myo5bP21271 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Myo5bP21271 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Myo5bP21271 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Myo5bP21271 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Myo5bP21271 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Myo5bP21271 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Myo5bP21271 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Myo5bP21271 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Myo5bP21271 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Myo5bP21271 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Myo5bP21271 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Myo5bP21271 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Myo5bP21271 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms