Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VimP20152 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VimP20152 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VimP20152 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VimP20152 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VimP20152 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VimP20152 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VimP20152 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VimP20152 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VimP20152 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VimP20152 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VimP20152 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VimP20152 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VimP20152 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VimP20152 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VimP20152 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VimP20152 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VimP20152 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VimP20152 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VimP20152 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VimP20152 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VimP20152 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VimP20152 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VimP20152 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VimP20152 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VimP20152 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VimP20152 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VimP20152 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VimP20152 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VimP20152 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VimP20152 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VimP20152 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VimP20152 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VimP20152 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VimP20152 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VimP20152 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VimP20152 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VimP20152 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VimP20152 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VimP20152 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VimP20152 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VimP20152 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VimP20152 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VimP20152 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VimP20152 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VimP20152 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
VimP20152 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VimP20152 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VimP20152 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VimP20152 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VimP20152 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VimP20152 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VimP20152 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VimP20152 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VimP20152 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VimP20152 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VimP20152 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VimP20152 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VimP20152 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VimP20152 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VimP20152 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VimP20152 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VimP20152 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VimP20152 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VimP20152 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VimP20152 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VimP20152 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VimP20152 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VimP20152 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VimP20152 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VimP20152 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VimP20152 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VimP20152 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VimP20152 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VimP20152 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VimP20152 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VimP20152 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VimP20152 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VimP20152 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VimP20152 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VimP20152 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VimP20152 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VimP20152 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VimP20152 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VimP20152 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VimP20152 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VimP20152 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VimP20152 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VimP20152 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VimP20152 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VimP20152 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VimP20152 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VimP20152 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VimP20152 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VimP20152 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VimP20152 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VimP20152 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VimP20152 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VimP20152 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VimP20152 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms