Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

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Length 128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cox5bP19536 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cox5bP19536 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cox5bP19536 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cox5bP19536 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cox5bP19536 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cox5bP19536 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cox5bP19536 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cox5bP19536 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cox5bP19536 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cox5bP19536 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cox5bP19536 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cox5bP19536 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cox5bP19536 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cox5bP19536 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cox5bP19536 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cox5bP19536 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cox5bP19536 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cox5bP19536 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cox5bP19536 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cox5bP19536 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cox5bP19536 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cox5bP19536 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cox5bP19536 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cox5bP19536 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cox5bP19536 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cox5bP19536 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cox5bP19536 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cox5bP19536 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cox5bP19536 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cox5bP19536 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cox5bP19536 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cox5bP19536 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cox5bP19536 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cox5bP19536 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cox5bP19536 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cox5bP19536 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cox5bP19536 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cox5bP19536 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cox5bP19536 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cox5bP19536 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cox5bP19536 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cox5bP19536 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cox5bP19536 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cox5bP19536 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cox5bP19536 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cox5bP19536 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cox5bP19536 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cox5bP19536 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cox5bP19536 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cox5bP19536 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cox5bP19536 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cox5bP19536 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cox5bP19536 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cox5bP19536 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cox5bP19536 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms