Protein–RNA interactions for Protein: P19473

Trap1a, Tumor rejection antigen P815A, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trap1aP19473 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trap1aP19473 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trap1aP19473 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trap1aP19473 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Trap1aP19473 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trap1aP19473 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trap1aP19473 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trap1aP19473 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trap1aP19473 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trap1aP19473 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trap1aP19473 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trap1aP19473 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trap1aP19473 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trap1aP19473 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trap1aP19473 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trap1aP19473 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Trap1aP19473 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms