Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Csn1s1P19228 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csn1s1P19228 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms