Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrgnP13609 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrgnP13609 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrgnP13609 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrgnP13609 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SrgnP13609 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SrgnP13609 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrgnP13609 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrgnP13609 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrgnP13609 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SrgnP13609 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrgnP13609 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms