Protein–RNA interactions for Protein: P13439

Umps, Uridine 5'-monophosphate synthase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UmpsP13439 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UmpsP13439 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UmpsP13439 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UmpsP13439 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UmpsP13439 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UmpsP13439 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UmpsP13439 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UmpsP13439 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UmpsP13439 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UmpsP13439 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UmpsP13439 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UmpsP13439 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UmpsP13439 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UmpsP13439 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UmpsP13439 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UmpsP13439 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UmpsP13439 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UmpsP13439 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UmpsP13439 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UmpsP13439 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UmpsP13439 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
UmpsP13439 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UmpsP13439 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UmpsP13439 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UmpsP13439 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UmpsP13439 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UmpsP13439 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UmpsP13439 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UmpsP13439 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UmpsP13439 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UmpsP13439 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UmpsP13439 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UmpsP13439 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
UmpsP13439 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UmpsP13439 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UmpsP13439 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UmpsP13439 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UmpsP13439 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UmpsP13439 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UmpsP13439 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UmpsP13439 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UmpsP13439 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UmpsP13439 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UmpsP13439 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
UmpsP13439 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UmpsP13439 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UmpsP13439 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UmpsP13439 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UmpsP13439 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UmpsP13439 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UmpsP13439 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UmpsP13439 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UmpsP13439 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UmpsP13439 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UmpsP13439 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UmpsP13439 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UmpsP13439 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UmpsP13439 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
UmpsP13439 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UmpsP13439 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UmpsP13439 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UmpsP13439 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UmpsP13439 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UmpsP13439 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UmpsP13439 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UmpsP13439 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UmpsP13439 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms