Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc6P10629 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc6P10629 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc6P10629 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc6P10629 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc6P10629 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc6P10629 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc6P10629 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxc6P10629 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxc6P10629 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hoxc6P10629 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxc6P10629 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc6P10629 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Hoxc6P10629 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxc6P10629 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxc6P10629 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxc6P10629 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxc6P10629 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxc6P10629 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc6P10629 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.7 ms