Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxa9P09631 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa9P09631 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms