Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hoxb7P09024 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hoxb7P09024 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hoxb7P09024 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hoxb7P09024 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hoxb7P09024 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hoxb7P09024 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hoxb7P09024 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hoxb7P09024 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hoxb7P09024 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hoxb7P09024 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hoxb7P09024 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hoxb7P09024 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hoxb7P09024 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Hoxb7P09024 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hoxb7P09024 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Hoxb7P09024 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Hoxb7P09024 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hoxb7P09024 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hoxb7P09024 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hoxb7P09024 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hoxb7P09024 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hoxb7P09024 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Hoxb7P09024 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hoxb7P09024 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hoxb7P09024 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hoxb7P09024 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Hoxb7P09024 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hoxb7P09024 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hoxb7P09024 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hoxb7P09024 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hoxb7P09024 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hoxb7P09024 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hoxb7P09024 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hoxb7P09024 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hoxb7P09024 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hoxb7P09024 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hoxb7P09024 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Hoxb7P09024 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Hoxb7P09024 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hoxb7P09024 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hoxb7P09024 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hoxb7P09024 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms