Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col3a1P08121 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Col3a1P08121 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col3a1P08121 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col3a1P08121 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col3a1P08121 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col3a1P08121 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col3a1P08121 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Col3a1P08121 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col3a1P08121 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col3a1P08121 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col3a1P08121 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col3a1P08121 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col3a1P08121 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col3a1P08121 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col3a1P08121 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col3a1P08121 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col3a1P08121 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col3a1P08121 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Col3a1P08121 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Col3a1P08121 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col3a1P08121 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col3a1P08121 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col3a1P08121 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col3a1P08121 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col3a1P08121 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col3a1P08121 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col3a1P08121 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col3a1P08121 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col3a1P08121 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col3a1P08121 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col3a1P08121 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col3a1P08121 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col3a1P08121 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col3a1P08121 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col3a1P08121 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col3a1P08121 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col3a1P08121 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col3a1P08121 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col3a1P08121 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col3a1P08121 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col3a1P08121 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col3a1P08121 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col3a1P08121 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col3a1P08121 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col3a1P08121 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col3a1P08121 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col3a1P08121 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col3a1P08121 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col3a1P08121 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col3a1P08121 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col3a1P08121 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Col3a1P08121 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Col3a1P08121 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col3a1P08121 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col3a1P08121 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col3a1P08121 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col3a1P08121 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col3a1P08121 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col3a1P08121 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms