Protein–RNA interactions for Protein: P06837

Gap43, Neuromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gap43P06837 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gap43P06837 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gap43P06837 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gap43P06837 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gap43P06837 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gap43P06837 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gap43P06837 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gap43P06837 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gap43P06837 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gap43P06837 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gap43P06837 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gap43P06837 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gap43P06837 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gap43P06837 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gap43P06837 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gap43P06837 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gap43P06837 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gap43P06837 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gap43P06837 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gap43P06837 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gap43P06837 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gap43P06837 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gap43P06837 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gap43P06837 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gap43P06837 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gap43P06837 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gap43P06837 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gap43P06837 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gap43P06837 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gap43P06837 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gap43P06837 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gap43P06837 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gap43P06837 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gap43P06837 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gap43P06837 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gap43P06837 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gap43P06837 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gap43P06837 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gap43P06837 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gap43P06837 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gap43P06837 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gap43P06837 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gap43P06837 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gap43P06837 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gap43P06837 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gap43P06837 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gap43P06837 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gap43P06837 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gap43P06837 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gap43P06837 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gap43P06837 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gap43P06837 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gap43P06837 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gap43P06837 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gap43P06837 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gap43P06837 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gap43P06837 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gap43P06837 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms