Protein–RNA interactions for Protein: P05201

Got1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1P05201 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Got1P05201 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Got1P05201 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Got1P05201 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Got1P05201 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Got1P05201 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Got1P05201 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Got1P05201 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Got1P05201 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Got1P05201 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Got1P05201 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Got1P05201 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Got1P05201 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Got1P05201 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Got1P05201 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Got1P05201 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Got1P05201 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Got1P05201 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Got1P05201 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Got1P05201 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Got1P05201 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Got1P05201 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Got1P05201 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Got1P05201 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Got1P05201 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Got1P05201 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Got1P05201 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Got1P05201 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Got1P05201 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Got1P05201 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Got1P05201 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Got1P05201 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Got1P05201 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Got1P05201 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Got1P05201 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Got1P05201 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Got1P05201 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Got1P05201 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Got1P05201 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Got1P05201 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Got1P05201 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Got1P05201 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Got1P05201 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Got1P05201 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Got1P05201 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Got1P05201 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Got1P05201 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Got1P05201 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Got1P05201 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Got1P05201 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Got1P05201 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Got1P05201 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Got1P05201 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Got1P05201 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Got1P05201 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Got1P05201 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Got1P05201 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Got1P05201 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Got1P05201 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Got1P05201 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Got1P05201 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Got1P05201 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Got1P05201 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Got1P05201 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Got1P05201 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Got1P05201 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Got1P05201 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Got1P05201 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Got1P05201 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Got1P05201 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Got1P05201 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Got1P05201 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Got1P05201 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Got1P05201 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Got1P05201 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Got1P05201 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Got1P05201 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Got1P05201 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Got1P05201 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Got1P05201 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Got1P05201 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Got1P05201 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Got1P05201 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Got1P05201 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Got1P05201 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Got1P05201 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Got1P05201 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Got1P05201 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Got1P05201 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Got1P05201 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Got1P05201 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Got1P05201 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Got1P05201 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Got1P05201 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Got1P05201 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Got1P05201 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Got1P05201 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Got1P05201 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Got1P05201 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Got1P05201 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms